Al instalarse en Green Hills, Sonic busca demostrar que tiene todas las cualidades de un verdadero héroe. Y la prueba heroica no se hace esperar: el villano Dr. Robotnik está conspirando de nuevo. Esta vez, con un misterioso socio Knuckles. Juntos buscan una esmeralda de valor incalculable, que contiene las fuerzas que pueden destruir civilizaciones enteras. Sonic se une al zorro Tails para viajar alrededor del mundo y encontrar la esmeralda antes de que caiga en las manos equivocadas.
